Toux chronique de l’enfant : une nouvelle approche thérapeutique ?
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Les chercheurs ont trouvés des microbiomes distincts dans les voies respiratoires, les systèmes gastro-intestinaux des enfants atteints de toux chronique.

Différentes maladies respiratoires associées à la toux chronique créent des déséquilibres microbiens distincts dans les voies respiratoires inférieures des enfants, selon une étude menée par des chercheurs de la NYU School of Medicine. L’étude, publiée en ligne ce mois-ci dans Pediatric Pulmonology, est la première à évaluer la population bactérienne des voies respiratoires et du système gastro-intestinal des enfants atteints de toux chronique à l’aide du séquençage de l’ADN bactérien.

Jusqu’à 20 % des enfants d’âge préscolaire ont une toux récurrente qui dure plus de quatre semaines. Contrairement à une toux aiguë, qui dure habituellement moins de deux semaines et qui est souvent associée à une infection des voies respiratoires, la toux chronique est souvent liée à un problème respiratoire ou gastro-intestinal sous-jacent comme l’asthme, les troubles des voies respiratoires supérieures ou le reflux gastro-oesophagien (RGO).

« La toux chronique peut avoir un impact négatif important sur la qualité de vie d’un enfant, et pour la traiter efficacement, il faut en identifier la cause avec précision « , dit l’auteur principal Mikhail Kazachkov, MD, professeur clinicien au département de pédiatrie et directeur de la division de pneumologie pédiatrique à l’hôpital Hassenfeld Children’s Hospital de l’Université de New York Langone. « Cette étude, la première du genre, pourrait améliorer l’évaluation et le traitement des enfants atteints de toux chronique en permettant aux cliniciens de mieux comprendre la maladie sous-jacente.

Dans la pratique actuelle, les cliniciens recueillent des échantillons de liquide ou de tissus et permettent aux bactéries de l’échantillon de se développer dans un plat afin de recueillir de l’information sur la population bactérienne des voies respiratoires et de poser un diagnostic. Grâce à cette nouvelle méthode de séquençage du gène de l’ARN ribosomal 16S, les chercheurs ont été en mesure de saisir la présence d’espèces bactériennes clés dans les voies respiratoires supérieures et inférieures et le système digestif des enfants qui étaient absentes de la méthode de culture traditionnelle.

« La disparité entre les résultats de la méthode traditionnelle de test et la méthode plus impartiale de séquençage de l’ADN met encore plus en évidence notre connaissance incomplète des populations microbiennes vivant dans le corps humain « , déclare l’auteur principal Leopoldo N. Segal, MD, professeur adjoint à la Division des soins pulmonaires, des soins intensifs et de la médecine du sommeil de l’Université de New York Langone.

L’étude comprenait 36 enfants vus au Pediatric Aerodigestive Center de l’Hôpital pour enfants de Hassenfeld qui souffraient de toux quotidienne depuis plus de huit semaines. Après l’évaluation clinique, les enfants ont été assignés à l’un des quatre groupes suivants : asthme, bronchite bactérienne prolongée (PBB), enfants atteints de troubles neurologiques nourris par voie orale et enfants atteints de troubles neurologiques nourris à l’aide d’un tube. Les enfants atteints de troubles neurologiques sont plus susceptibles d’éprouver des problèmes respiratoires en raison de l’effet d’un état sur la force musculaire, la respiration et la déglutition d’un enfant.

Les chercheurs ont prélevé un total de 354 échantillons des voies respiratoires des enfants jusqu’à leur tractus gastro-intestinal. Ils ont ensuite utilisé des techniques génomiques et bioinformatiques de pointe pour analyser les millions de morceaux d’ADN bactérien dans les échantillons, identifiant des caractéristiques microbiennes distinctes qui n’étaient pas détectables par la méthode de culture conventionnelle.

De façon significative, les microbiomes des enfants atteints de troubles neurologiques étaient étonnamment différents de ceux des enfants atteints d’asthme et de bronchite. Les voies respiratoires inférieures des enfants atteints de troubles neurologiques nourris par voie orale ont été enrichies de Veillonella, une bactérie que l’on trouve habituellement dans la bouche, ce qui peut indiquer cette bactérie comme marqueur d’aspiration.

Chez les enfants atteints de troubles neurologiques, l’aspiration de nourriture, de mucus ou de salive dans les poumons est courante et peut causer le développement rapide d’une maladie pulmonaire grave. Il s’agit d’une préoccupation croissante pour les cliniciens, car les taux d’enfants avec aspiration ont augmenté ces dernières années en raison de taux de survie plus élevés chez les enfants atteints de troubles neurologiques et génétiques graves.

« Il est extrêmement difficile de diagnostiquer l’aspiration avec certitude, mais les données nous donnent l’espoir qu’à l’avenir, nous pourrons diagnostiquer les maladies pulmonaires liées à l’aspiration en utilisant certaines signatures microbiennes et fournir le traitement approprié pour prévenir les lésions pulmonaires « , dit le Dr Kazachkov.

Les chercheurs ont également noté que dans tous les diagnostics, l’inflammation des voies respiratoires inférieures était associée à une similarité entre le microbiote des voies respiratoires inférieures et le microbiote des voies respiratoires supérieures. Les chercheurs suggèrent que l’inflammation et les sécrétions des voies respiratoires abondantes qui y sont associées nuisent à la clairance microbienne naturelle de l’organisme, permettant ainsi à un plus grand nombre de bactéries d’envahir les voies respiratoires inférieures et d’augmenter l’inflammation.

« La caractérisation de ces caractéristiques microbiennes distinctes est une étape passionnante vers des thérapies ciblées plus personnalisées pour les enfants ayant diverses causes de toux chronique « , dit le Dr Segal.

Les chercheurs reconnaissent qu’une des limites de l’étude est l’absence d’un groupe témoin d’enfants en bonne santé ; des préoccupations éthiques rendant impossible l’exécution d’interventions invasives inutiles comme la bronchoscopie ; et notent que d’autres études longitudinales avec des cohortes plus importantes sont justifiées.

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